港澳辦副主任鄧中華表示，「港區國安法」立法後，在「極其特殊」的情況下，中央應當保留管轄權，處理嚴重危害國家安全的案件。

法律界立法會議員郭榮鏗認為，有關中央有管轄權的說法違憲；港大法律學院公法講座教陳文敏表示，有關言論相當令人擔憂，認為如果內地國安機構在香港有司法權，即代表「一條龍」完成拘捕、調查、審問、判決甚至被告坐監的程序。基本法委員會前委員饒戈平就認為，中央在香港國安問題上，有立法權、執法權，以及特定條件下的司法權。