港區國安法生效第一日，有市民被搜出港獨印刷品同港獨旗幟，涉嫌違反新法例被捕。基本法委員會委員陳弘毅說，港區國安法條文中，無明文提及叫口號、使用標語或持某些旗幟的行為，只能以現有抽象條文估計，有關行為是否觸犯法例。而如果藏有港獨旗幟並準備使用，可說當事人企圖犯罪，但亦要有足夠證明，認為存在灰色地帶。

對於港區國安法列明，罪成者喪失參選立法會、區議會等的資格，但並無講述期限。陳弘毅說新法無明確處理，亦非港區國安法要處理的問題，他並不清楚立法原意，不排除將來特區政府向立法會提出修訂選舉法例。

新法列出3種情況中央能行使管轄權，當中包括香港政府無法有效執行港區國安法的嚴重情況，以及國家安全面臨重大現實威脅，陳弘毅認為以上兩種情況出現機會非常低，他分析去年反修例衍生的示威衝突，未算達到警方無法有效控制的情況。