全國人大常委會法工委主任沈春耀說，駐港國家安全公署的管轄權，只是針對極少數嚴重危害國家安全的犯罪案件，中央亦不願意看到出現困難局面和重大現實威脅，令中央要行使三種特定情形下的案件管轄權，但是制度建設必須考慮到各種風險和因素，並作出安排。

沈春耀在國新辦記者會表示，國家安全公署管轄案件並啟動管轄權等，在法律有非常嚴格和明確的規定，《港區國安法》亦有明確規定整套執法、司法活動，包括由駐港國家安全公署負責立案偵查，由最高人民檢察院指定有關檢察機關負責起訴，審判由最高人民法院指定有關法院負責。

沈春耀又表示，《港區國安法》明確規定保障香港居民，依照基本法及各項國際公約享有的權利和自由，但他指出，任何權利都有法律規定的明確界線和範圍，越過了底線和邊界就不行，必須取得平衡，尊重保障人權和維護國家安全，兩者是相輔相成。