在台灣，陸委會關注「港區國安法」生效，建議台灣人審慎觀察，如非必要，應避免前往或過境香港、澳門及大陸。

副主委邱垂正說，港區國安法充分顯示中共為維護政權安全，無所不用其極，全面封殺無法容忍的意見，與全世界為敵。邱垂正認為，批判過中共或支持香港反修例運動的台灣人，都屬於高風險群組。

邱垂正又強調，台北政府從未介入香港事務，駐港辦事處在香港的運作，一向符合雙方規範，從未逾越分際，希望台港雙方良性互動，強調不會主動撤館，但已經有應變計劃。