有報道指，華大基因在港的華昇診斷中心，過去曾經有5個樣本經衞生署覆檢後證實是假陽性。政府回覆傳媒查詢表示，現階段未有證據顯示華大基因及華昇診斷中心為政府提供的檢測服務質素未達標準。

政府發言人表示，公共衞生化驗服務處與私營化驗所，以不同平台檢測，出現不一致結果，並非罕見，過往偶有發生。若有需要，衞生署會再進一步測試，所有為政府提供檢測服務的私營化驗所，必須參加及通過衞生防護中心的檢測外部質量評估項目，確保檢測技術水平質素。

發言人又提到，設於中山紀念公園體育館的臨時氣膜實驗室，已於8月18日通過外部質量評估項目，確認混樣檢測的準確性，而華大基因及華昇診斷中心分別在6月及7月，就檢測設施參加並通過外部質量評估項目。