上週日，在鑑定COVID-19病毒的來源方面取得了突破，《星期日泰晤士報》引述了石正麗最近發表的論文（2020年2月），文章指研究來自2013年在雲南的蝙蝠樣品中發現一種名為RaTG13的病毒，該病毒與COVID-19的病毒的基因排序相似度高達96.2％。

該論文由多位作者合著（Zhou et al., 2020），其中包括武漢病毒研究所負責人石正麗，他們對病毒進行了完整的基因排序對比，並說武漢病毒研究所有一個蝙蝠冠狀病毒樣品，名為RaTG13，研究發現它與COVID-19的匹配率為96.2％。（Hendry-Tennent，2020）

這篇論文屬公開可免費瀏覽的研究文章，我們將在下面詳細介紹該研究的一些細節，因為它不僅揭示了RaTG13病毒的來源，而且還指出病毒的傳播媒介，令人非常震驚，但媒體報導大多忽略，特此補漏。

必須強調的是，學術論文並沒有說明COVID-19病毒的來源，只是說明了RaTG13病毒的來源。同樣，《星期日泰晤士報》的發現也只是在RaTG13病毒的來源情節上增加了重要的資料，但仍非關於COVID-19病毒的來源，即使兩者的相似度很高。

首先，Zhou et al.（2020）揭示RaTG13的來源是來自雲南，他們發現RaTG13與2019-nCoV之間有高度相似性，翻譯後引述如下：

“然後，我們發現蝙蝠冠狀病毒（BatCoV RaTG13）的RNA依賴性RNA聚合酶（RdRp）的短區域（先前在雲南省的 中菊頭蝠 中檢測到）顯示出與2019-nCoV序列的高度相同性。我們對該RNA樣品（GISAID登錄號EPI_ISL_402131）進行了全長測序。 Simplot分析顯示，2019-nCoV在整個基因組中與RaTG13非常相似（圖1c），整體基因組序列一致性為96.2％。” （Zhou et al, 2020）

原文如下: (We then found that a short region of RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) from a bat coronavirus (BatCoV RaTG13) — which was previously detected in Rhinolophus affinis from Yunnan province — showed high sequence identity to 2019-nCoV. We carried out full-length sequencing on this RNA sample (GISAID accession number EPI_ISL_402131). Simplot analysis showed that 2019-nCoV was highly similar throughout the genome to RaTG13 (Fig. 1c), with an overall genome sequence identity of 96.2%.) (Zhou et al., 2020, emphasis added)

而《星期日泰晤士報》進一步發現RaTG13的來源情節尚有下文，根據報導：”在2013年，有六名清理蝙蝠糞便的人染上嚴重肺炎，科學家從中國西南一個蝙蝠出沒的前銅礦山將冷凍樣本送到武漢實驗室。《星期日泰晤士報》援引了一名醫務人員的話，其主管在急診科工作，負責治療這六名男子，他們中有三人死亡，最可能的原因是與蝙蝠的冠狀病毒有關。隨後，武漢病毒研究所的病毒專家石正麗對雲南省的同一座礦山進行了研究。（Rai, 2020）

換句話說，關於RaTG13病毒樣本的來源現在有兩種不同說法，但兩種說法都證實RaTG13的來源是2013年從雲南所得，但未確定是否與COVID-19的來源有關。另外，兩項報導均證實，武漢病毒研究所自2013年以來已從雲南獲得了RaTG13病毒，用作CoV病毒的研究。

必須注意，即使兩者的相似度高達96.2％，許多科學家強調基因組序列的3.8％差異已可能需要數十年時間才能突變至相同，然而，論文指出RaTG13與COVID-19的相似度要比許多其他CoV病毒高得多，如序列相似度如圖所示（圖1）：

圖1 基於2019-nCoV WIV04的全長基因組序列的相似性圖。 SARS-CoV BJ01，蝙蝠SARSr-CoV WIV1，蝙蝠冠狀病毒RaTG13和ZC45的全長基因組序列用作參考序列。資料來源：(Zhou, 2020)

圖1 基於2019-nCoV WIV04的全長基因組序列的相似性圖。 SARS-CoV BJ01，蝙蝠SARSr-CoV WIV1，蝙蝠冠狀病毒RaTG13和ZC45的全長基因組序列用作參考序列。資料來源：(Zhou, 2020) 

另一項更重要的發現是關於COVID-19的傳播途徑，過去一直指COVID-19不是空氣傳播，但該論文有新發現，但差不多所有報導都只關注RaTG13來源的故事情節，而沒有關注同一篇論文中有關病毒傳輸渠道的發現：

“根據這些發現，我們認為該疾病可以通過空中傳播。” (Zhou et al., 2020)

換句話說，早在2020年2月已經有警告稱COVID-19可通過空氣傳播，但世衛組織(WHO)等到7月7日才通知世界有關的情況：

“世衛組織感染預防和控制技術負責人Benedetta Allegranzi 於星期二在日內瓦舉行的新聞發布會上說：'……在公共場所，尤其是在非常特殊的條件下，擁擠，封閉，通風不良的環境中，我們不能排除空氣傳播的可能性。'”（Guardian, 2020）

這項發現可以解釋為什麼在某些特定條件下，即使保持社交距離也無法阻止病毒傳播。這些可讓COVID-19病毒通過空氣傳播的特殊情況的證據越來越多，在7月6日(周一)便有一封來自32個國家的239位科學家的公開信，信中概述了證據說明“漂浮的病毒顆粒可以感染吸入的人。”(floating virus particles can infect people who breathe them in.) (Swift, 2020)

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參考資料

Hendry-Tennent, Ireland (2020) Report claims Chinese scientists found virus 96 percent similar to COVID-19 in 2013 but kept it secret, 06/07/2020, Newshub. https://www.newshub.co.nz/home/world/2020/07/report-claims-chinese-scientists-found-virus-96-percent-similar-to-covid-19-in-2013-but-kept-it-secret.html

Guardian (2020) Global report: WHO says ‘evidence emerging’ of airborne coronavirus spread, July 8. https://www.theguardian.com/world/2020/jul/08/who-says-evidence-emerging-of-airborne-coronavirus-spread?CMP=fb_gu&utm_medium=Social&utm_source=Facebook&fbclid=IwAR1dst4rVTqA9r6iio81sDKwYsrUaxzxvThmXnm7JN9pQ-9RJTeSuO9WR9A#Echobox=1594188362

Rai, Arpan (2020) Covid-like virus was sent to Wuhan in 2013: Report, hindustantimes July 5. https://www.hindustantimes.com/world-news/covid-like-virus-was-sent-to-wuhan-in-2013-report/story-VkKCUGaU0EtM1WsUWuJF0N.html

Swift, R. (2020) Japan supercomputer suggests changes to travel, work amid airborne virus threat, Reuters, July 9.https://www.reuters.com/article/us-health-coronavirus-japan-supercompute-idUSKBN2490PE?utm_campaign=trueAnthem%3A%20Trending%20Content&utm_medium=trueAnthem&utm_source=facebook&fbclid=IwAR3kvXi7rIYXhVPNFQVZlZKI1vFhKBkqyCUof3SxCVNhzui9W95citFstw0

Zhou, P., Yang, X., Wang, X. et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 579, 270–273 (2020). https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7