瑪嘉烈醫院兒科傳染病科顧問醫生關日華表示，本港至今治療近1千名確診新型肺炎的兒童，部分康復後肺功能減弱，情況普遍，有患者康復三四個月後，發現味覺和嗅覺異常，亦有兒童康復出院後出現「類川崎症」的嚴重併發症，包括發燒、出疹和眼紅等，需要入住深切治療部。

對於政府批准降低接種復必泰疫苗年齡下限至12歲，港大醫學院兒童及青少年科學系臨床副教授葉柏強建議，當局可安排外展隊到校接種服務，讓學生在熟悉環境打針。香港兒科醫學院院長謝詠儀表示，如果兒童出現感冒或腸胃炎等急性病應待康復後才接種，至於如果有嚴重過敏反應，則需要經過敏症醫生評估，但一般濕疹或哮喘等患者，如果並非要經常服藥都可以打針，又呼籲需要照顧兒童的成年人，包括家長和學校教職員等盡快接種疫苗，保護兒童免受感染。

另外，本港多名兒科醫生早前亦就疫情對兒童健康影響展開研究，在去年首兩波疫情，訪問本港約29000個家庭，發現兒童運動量減少，睡眠質素轉差，家長精神壓力亦上升，反映在疫情下學校長期停課等，對兒童發展有深遠影響。